核桃JrOFP基因家族鉴定及其响应冷胁迫基因的转录表达分析

作者：刘凯; 李洋; 纪莲莲; 林娜^*; 王红霞^*; 王梦娜; 王娇; 孔祥文

来源：河北农业大学学报, 2023, 46(01): 55-62.

DOI：10.13320/j.cnki.jauh.2023.0009

• 核桃
• 冷胁迫
• OPF基因家族
• 转录分析

OFP(OVATE Family Protein)在植物调控响应逆境过程有重要作用。本研究基于核桃全基因组数据对其OPF基因家族成员进行筛选鉴定，并对其成员结构进行生物信息分析，同时对该家族成员进行时空转录水平分析。结果表明，核桃OFP基因家族包含21个成员，编码21条蛋白，均为亲水性蛋白；均含有典型的DUF623结构域；系统进化发现，该基因家族成员分为4个亚组。冷胁迫后经转录组分析，21个成员对冷胁迫均具有不同程度的响应，并在不同组织中存在特异性表达。本研究为进一步解析核桃OPF基因家族成员在响应冷胁迫过程中的分子机制提供了理论支撑。

• 单位
  河北农业大学; 滨州职业学院