AMETH＿3452基因在拟无枝酸菌中的系统发育分析

作者：唐标; 吴静; 郑华军; 赵维; 杨华

来源：浙江农业科学, 2021, 62(04): 763-767.

DOI：10.16178/j.issn.0528-9017.20210437

• AMETH3452
• 拟无枝酸菌
• 系统发育

AMETH3452基因是拟无枝酸菌(Amycolatopsis)中发现的一个放线菌的保守基因,位于拟无枝酸菌属中的环形基因组中间位置。为进一步探究该基因的序列特征并挖掘该基因的应用潜力,本研究将该基因构建在pET28载体上,在大肠杆菌中进行表达,使用蛋白预测网站进行了二级结构和保守区分析,对其直系同源基因在拟无枝酸菌属进行了系统发育分析。AMETH3452蛋白在大肠杆菌的上清液中可溶性表达。该基因在拟无枝酸菌属的核酸同源性为79.23%～99.02%,在300～500 bp的序列一致性较高。该蛋白序列共269个氨基酸,作为分子标记在76个拟无枝酸菌中进行系统发育分析后发现,东方拟无枝酸菌分支和甲基拟无枝酸菌分支稳定性高,同时可将东方拟无枝酸菌分支分成AORIS和AMEDS 2个可稳定的分支。以上研究将为AMETH3452基因作为检测环境、动物或临床上的放线菌或系统发育应用研究提供依据。

• 单位
  中国科学院深圳先进技术研究院; 上海人类基因组研究中心; 浙江省农业科学院