CapG在肝细胞癌中的表达及临床意义

作者：刘小花; 杜红飞; 谢光素; **艳; 余扬; 王桂香; 陈涛

来源：标记免疫分析与临床, 2023, 30(09): 1546-1554.

• CapG
• DNA甲基化
• 肝细胞癌
• 生物信息学

目的 利用在线生物信息学数据库，通过组织和细胞水平的实验验证CapG基因在肝癌中的表达和临床意义。方法通过分析UALCAN和GEPIA数据库，获得CapG基因在肝细胞癌患者中的mRNA转录表达水平、DNA甲基化状态和临床病理特征等；用Kaplan-Meier Plotter绘制肝细胞癌患者的生存曲线，用HPA分析CapG的蛋白水平，用Kaplan-Meier Plotter绘制肝细胞癌患者的生存曲线，用HPA分析CapG的蛋白水平。用String网站构建相应蛋白的相互作用网络，用LinkedOmics工具对CapG共表达的基因进行富集分析；此外，用免疫组化法验证CapG在肝癌组织芯片中的表达，用定量PCR法测定CapG在肝癌细胞水平的表达。结果 肝癌患者肝组织中CapG基因的mRNA表达水平和蛋白水平均明显升高(P<0.001),CapG的高mRNA表达水平与DNA甲基化状态的降低明显相关。免疫组织学和细胞水平的实验结果证实了CapG在肝细胞癌中的明显高表达(P<0.05)。String在线分析结果表明，与CapG相互作用的蛋白质参与了生物过程，包括参与肌动蛋白聚合、转录调控、蛋白质运输等生物过程；LinkedOmics富集分析表明，这些共同表达的基因在肝癌组织中可以促进细胞因子代谢过程、T细胞激活、免疫系统的调节、细胞黏附调节以及细胞黏附的蛋白质复合物的合成等。此外，CapG mRNA的高表达水平与肝癌患者的总生存期和疾病特异性生存期显著相关(P<0.001)。结论 基于生物信息学和组织及细胞水平的实验表明，肝癌组织中CapG基因的高表达与肝癌患者的不良生存期密切相关。CapG基因可能是诊断和治疗肝癌患者的潜在靶点。

• 单位
  成都医学院第一附属医院; 成都市新都区人民医院