青海茄参MYB转录因子家族生物信息学及应答低温胁迫分析

作者：赵悦; 赵艳艳^*; 李强锋; 段红俊

来源：分子植物育种, 2023, 1-10.

• 青海茄参
• 低温诱导
• 转录组
• MYB转录因子

作为植物体内最大的一类转录因子，MYB转录因子对植物生长发育起到了重要的调控作用。本研究基于转录组数据对青海茄参(Mandragora chinghaiensis) MYB转录因子家族成员的理化特性、蛋白保守结构域以及跨膜结构域等进行生物信息学分析。结果共预测到37个MYB家族蛋白。预测的MYB家族蛋白有18个理论等电点小于7为偏酸性蛋白，其余为偏碱性蛋白；亲水性系数均为负数，推测其为亲水蛋白，无明显信号肽；二级结构分析得知，α-螺旋和无规卷曲占比较大，其次为延伸链和β-转角。除2个家族蛋白存在跨膜结构域，其余都为非分泌蛋白；亚细胞定位预测显示，多数家族蛋白均存在于细胞核，极少数存在于细胞质、细胞外等部位，符合转录因子分布特点。筛选出5个低温诱导下显著差异表达的MYB转录因子进行qRT-PCR分析，发现在低温处理的24 h内McMYB-86显著上调表达，McMYB-4和McMYB-44先显著上调后显著下调，McMYB-48和McMYB-1R1则是先下调后上调。这些丰富的表达模式暗示MYB家族在青海茄参低温响应过程中可能参与多条调控途径，其相关基因功能具有重要研究价值。

• 单位
  青海大学农牧学院