染井吉野樱PEBP基因家族鉴定及生物信息学分析

作者：吴水涵; 宋炎峰; 李蒙; 叶琦; 伊贤贵; 王绍军; 王贤荣

来源：分子植物育种, 2021, 1-8.

• 染井吉野樱
• PEBP
• 生物信息学
• 蔷薇科

磷脂酰乙醇胺结合蛋白（phosphatidyl ethanolamine binding protein， PEBP）基因家族的氨基酸结构中存在保守的磷脂酰乙醇胺结合蛋白结构域，对调控植物开花起着至关重要的作用。本研究以染井吉野樱全基因组数据为基础，采用生物信息学方法鉴定出13个PEBP基因，依次命名为PYPEBP1～PYPEBP13，然后进一步分析了家族中各基因结构、理化性质，对PEBP蛋白的亚细胞定位、二级结构以及磷酸化位点进行预测，并构建系统发育树。结果表明，染井吉野樱的PEBP基因家族不同蛋白质序列的长度和特性都存在较大差异；13个染井吉野樱PEBP基因大部分成员含有4个外显子和3个内含子，Motif-3、Motif-4、Motif-5和Motif-6是染井吉野樱PEBP基因的特征基序；蛋白的亚细胞定位预测显示，这13个PEBP基因的蛋白分别位于细胞核与细胞质中；蛋白质二级结构分析显示，染井吉野樱PEBP基因的蛋白质二级结构十分相似，PYPEBP5和PYPEBP12蛋白结构中无规则卷曲占比最高，而β-转角比例最低；潜在的磷酸化位点预测分析表明，除PYPEBP3、PYPEBP7、PYPEBP8和PYPEBP10蛋白没有潜在的酪氨酸Tyr磷酸化位点外，其余PEBP蛋白均含有潜在的丝氨酸（Ser）、苏氨酸（Thr）和酪氨酸（Tyr）磷酸化位点，各蛋白中不同磷酸化位点的数量差异显著；系统发育分析表明，染井吉野樱PEBP基因与拟南芥PEBP基因亲缘关系最近，各个家族成员均可聚到一起。本研究结果为后续深入研究染井吉野樱PEBP基因家族的功能提供参考。

• 单位
  南京林业大学; 南方现代林业协同创新中心