草鱼MyoD基因SNP和Indel标记的筛选及其与生长性状的关联分析

作者：陈静; 何吉祥; 樊佳佳; 黄龙; 吴本丽; 宋光同; 汪翔; 武松

来源：江苏农业学报, 2018, 34(03): 612-616.

DOI：10.3969/j.issn.1000-4440.2018.03.019

• 草鱼
• MyoD基因
• SNP标记
• Indel标记
• 生长性状

为探索MyoD基因多态性对草鱼(Ctenopharyngodon idella)生长性状的影响,采用PCR产物直接测序的方法,检测草鱼MyoD基因上的突变位点,并分析其与草鱼生长性状的相关性。结果表明:在草鱼MyoD基因上筛选到4个多态性高、分型稳定的突变位点,即M1(940后T碱基的插入)、M3(1630后重复单元AATAGCCT的缺失)、M4(G1669A)和M5(A1681T)。M1位点不同基因型个体间的体长、全长、尾柄长和尾柄高存在显著差异(P<0.05),纯合缺失基因型(DD)显著大于纯合插入基因型(TT);M3和M4位点不同基因型个体间的生长性状差异均不显著(P>0.05);M5位点不同基因型个体间的体质量、体宽、体高和眼间距存在显著差异(P<0.05),优势基因型为TT。MyoD基因的M1和M5突变位点可作为草鱼选育的候选分子标记。

• 单位
  农业部; 安徽省农业科学院水产研究所