摘要
环核苷酸门控通道蛋白(cyclic nucleotide-gated channel proteins, CNGCs)是钙离子转运通道家族基因之一,对植物的生长和发育,信号传导和非生物胁迫等方面发挥重要作用。本研究采用生物信息技术对马铃薯CNGCs全基因家族的理化性质、亚细胞定位、基因结构、顺式作用元件、染色体定位等进行分析。筛选出24个基因家族成员,定位在13个染色体上,鉴定出10个motif。通过CNGCs转录组数据分析,得出马铃薯不同组织中的同一基因表达存在较大差异,同一组织中的不同基因表达差异明显。本研究对马铃薯中CNGCs数据进行深入分析,为马铃薯抗逆性相关研究提供了数据基础。
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