基于重测序的杨梅InDel标记开发与果实性状关联分析

作者：张淑文; 俞浙萍; 孙鹂; 武祥琪; 梁森苗; 郑锡良; 戚行江^*

来源：分子植物育种, 2022, 20(06): 1890-1900.

DOI：10.13271/j.mpb.020.001890

• 杨梅
• 优株
• InDel标记
• 果实性状
• 关联分析

基于杨梅(Myrica rubar Sieb. et Zucc.)重测序数据,开发了覆盖基因组的InDel标记,以10份种质资源为试验材料进行了果实性状统计分析、群体结构与聚类分析、关联分析与基因预测。结果显示:10个果实外观性状中变异系数在0.64%～7.13%之间,13个果实品质性状中变异系数在2.05%～12.09%之间,总酸变异系数最大,试材表型变异范围较大;92个InDel标记在10份种质中均具有多态性,共扩增出293个位点,平均每个标记检测到等位变异位点3.18个;群体结构与聚类分析表明,试材可分为2个亚群,分别是以‘荸荠种’和‘东魁’为代表材料的亚群,并且3个优株均与代表材料间存在核苷酸差异;关联分析发现,24个InDel标记关联到22个性状和77个位点,其中2个标记与6个性状关联,5个标记与4个性状关联,说明在杨梅中也普遍存在不同性状的连锁遗传现象;通过对关联基因预测,共检测到5个相关功能的候选基因。本研究中开发的高质量InDel标记为杨梅种质遗传多样性分析提供鉴定基础,筛选到的候选基因为分子辅助育种提供了理论依据。

• 单位
  浙江省农业科学院