一种脉冲星/CNS组合导航方法,属于航天器自主轨道确定领域。该方法设计了UKF/H∞滤波器,融合天文导航和脉冲星导航系统(CNS)提供的导航定位数据,并在脉冲星导航系统中,提出了历元间差分法以消除时钟误差和脉冲星位置误差。本发明能够获得高精度的航天器位置信息,为航天器提供长时间、高精度的自主导航,使其定位精度不受星载时钟和测量设备的限制。