人工构造湿地主要利用湿地中植物、微生物和基质之间的物理、化学和生物作用共同达到污水净化的目的。其主要机理为:植物根系形成网络,传递和释放氧,吸收一部分营养物质,为微生物提供生长场所,并提供好氧、厌氧条件。好氧微生物分解有机物成CO2和H2O,硝化细菌和反硝化细菌去除氮,聚磷菌去除磷。主要是生化反应,但各自需要一定的条件。同时还有吸附沉淀作用,但存在吸附饱和度。