一种用于芯片质控的通用序列标签寡核苷酸探针的设计

作者：杨琼; 沈年汉; 蔡翠霞; 周珏宇; 李凌; 郑文岭

来源：中国热带医学, 2011, 11(1): 39-42.

• 寡核苷酸芯片
• 质量控制
• 探针设计

目的 设计一种带有通用序列标签的寡核苷酸探针以应用于寡核苷酸芯片点样的质量控制.方法 以HIV寡核苷酸探针作为核心序列,在其一端或两端连接上多种通用序列标签(UST)构建新型探针.然后打印芯片,以Cy5标记的通用引物(Cy5-UP,与UST互补)进行杂交,筛选出5条荧光信号强的探针,重新打印芯片.再分别以不同浓度梯度的、Cy5标记的通用引(Cy5-UP)和随机引(Cy5-RP)与芯片杂交,比较两者杂交效率.结果 Cy5-Up的杂交结果显著优于Cy5-RP的杂交结果,特别是在较低浓度时.结论 利用Cy5标记的通用引物检测探针上的通用序列标签,可以为芯片点样的质量控制提供一种更有效的方法.

• 单位
  南方医科大学