尖孢镰刀菌全基因组测序及其致病相关基因分析

作者：文增叶; 李定华; 代梦瑶; 杨野; 杨启良; 崔秀明; 年洪娟

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(03): 1105-1112.

DOI：10.13417/j.gab.039.001105

• 三七
• 根腐病
• 尖孢镰刀菌
• 基因组
• MAPK途径

尖孢镰刀菌是导致三七根腐病的病原之一。本研究采用Illumina高通量测序技术对三七根腐病原菌(Fusarium oxysporum)的基因组扫描测序,并进行了基因组序列分析、基因功能注释和比较基因组学分析,从全基因组水平鉴定致病相关基因。扫描结果表明,基因组大小为48.12 Mb,G+C含量为51.5%,15 746个基因编码区(CDS),其中11 330个基因(71.95%)可以在COG数据库中得到其分类信息,编码有功能的蛋白6 022个。该序列已经提交GenBank数据库,登录号为SAMN09976373。进一步分析得到细胞壁降解相关基因45个,搜索数据库中F. oxysporum MAPK级联途径组分的基因序列,与酿酒酵母中MAPK级联途径进行比对并进行系统进化分析。研究结果对深入理解尖孢镰刀菌导致三七致病的分子机理,从而进一步有效控制病害的发生具有重要意义。

• 单位
  生命科学技术学院; 昆明理工大学