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摘要
萱草是国内外广泛栽种的园林花卉，观赏价值极高。本研究利用转录组测序大量开发EST-SSR标记，对收集的60份萱草属种质资源进行聚类分析，同时调查花色、花葶高度、花朵直径、开花早晚、开花天数和连续开花特性等6个表型性状，对主要观赏性状与EST-SSR标记进行了连锁分析。结果表明，转录组共鉴定出7 335个EST-SSR位点，三碱基重复位点数量最多，有3 991个，占总量的54.4%，其次是两碱基重复，占总量的38.8%。随机合成的300对EST-SSR引物中，212对(70.1%)引物能扩增出预期大小的片段，67对(22.3%)引物在萱草不同品种间存在多态性。20对多态性引物利用共扩增出159个多态性位点，平均每个标记7.950个多态性位点。多态信息含量(PIC)分布范围为0.365～0.811，平均值0.640，表明供试群体遗传多样性较丰富。聚类分析和遗传结构分析结果基本一致，将整个群体分为3个类群，体现了萱草不同品种之间的亲缘关系和特异性。基于20个EST-SSR标记和6个表型性状进行连锁分析，发现标记HF19与花朵直径极显著相关(P<0.01)，解释了18.24%的表型变异，而标记HF41和HF47与花朵直径和开花持续特性显著相关(P<0.05)，分别解释了11.27%和12.83%的表型变异。研究结果将加快推进萱草种质资源的分子辅助育种进程，为今后培育更多的优良萱草新品种提供理论依据。
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