猪SUMO1基因的碱基序列特征及其在猪肺炎支原体感染过程中的表达

作者:王丽; 杨晓阳; 曹静; 赵为民; 涂枫; 付言峰; 李碧侠; 陈哲; 任守文; 方晓敏*
来源:江苏农业学报, 2020, 36(05): 1229-1236.

摘要

根据NCBI上GenBank的猪类泛素蛋白修饰分子1(SUMO1)基因碱基序列(NM001112676.1),设计编码区全长上、下游引物,成功克隆了猪SUMO1基因完整的编码区序列。经生物信息学软件分析发现猪SUMO1基因的蛋白质编码区(CDS)全长306 bp,编码101个氨基酸,SUMO1的蛋白质氨基酸序列在物种间高度保守。SUMO1基因在猪心、肝、脾、肺、肾、小肠及肌肉组织中均有表达,且在肺部表达较高。猪肺炎支原体感染原代猪肺泡巨噬细胞后SUMO1的mRNA表达水平显著升高。参与调控炎症反应的基因,如TLR2、P65和RXRα均存在潜在的SUMO化修饰位点,并且猪肺炎支原体感染后它们的mRNA表达水平极显著升高。