lprG基因表达上调对THP1细胞表达谱的影响

作者：曹雯; 宛宝山; 陈伟伟; 张冉冉; 乐军; 陈晋^*

来源：同济大学学报(医学版), 2018, 39(04): 11-16.

DOI：10.16118/j.1008-0392.2018.04.003

• lprG基因
• THP1细胞
• 转录组测序

目的分析lprG基因表达上调对THP1细胞表达谱的影响。方法建立稳定表达lprG的THP1细胞系,通过q PCR及Western印迹法检测lprG的表达。用RNA-seq分析稳定表达lprG对THP1细胞基因表达谱有何影响。对测序数据进行分析,作GO及KEGG通路的显著性富集分析,并选取6个差异表达基因进行q PCR验证。结果成功构建稳定表达lprG的THP1细胞系。RNA-seq检测发现共有712个差异表达的基因,其中419个上调,占58.8%,293个下调,占41.2%。富集分析显示,lprG的异位表达可影响THP1细胞多种生理或代谢过程。q PCR结果与RNAseq结果一致。结论 lprG会影响THP1细胞内与Toll样受体信号通路、补体、细胞吞噬、溶酶体及过氧化物酶体等过程相关的基因的表达,这可为进一步研究lprG与巨噬细胞相互作用机制提供前期基础。

• 单位
  同济大学附属上海市肺科医院