基于de novo高通量测序的叶尔羌高原鳅微卫星位点筛选与多态性分析

作者：王锦秀; 宋勇; 王新月; 陈生熬; 任道全^*

来源：塔里木大学学报, 2020, 32(02): 25-32.

• 叶尔羌高原鳅
• 微卫星
• 二三碱基重复
• 多态性

为保护该鱼类资源而开发塔里木河流域叶尔羌高原鳅(Triplophysa yarkandensis)群体的微卫星标记,合成二、三碱基重复类型的100对引物,筛出33对多态性引物,进一步分析其多态性。结果显示:102尾叶尔羌高原鳅,其平均等位基因和有效等位基因分别为43.848和12.163,平均观测杂合度(Ho)为0.239,平均期望杂合度(He)平均值为0.902,多态性信息含量PIC数值为0.890。碱基重复类型中二碱基重复次数在6～61次,三碱基在5～25次,四碱基在7～27次、五碱基在6～12次,六碱基在5～17次。研究发现,碱基数越多,重复次数越少,且随着碱基数量的增加,相应微卫星标记的数量也逐渐减少。同时表明二碱基重复的微卫星标记明显比三碱基重复类型的微卫星标记多态性指数高。

• 单位
  新疆生产建设兵团; 塔里木大学; 动物科学学院