摘要
目的追踪昆明市男男性行为者(MSM)中1型艾滋病病毒(HIV-1)基因型的流行趋势和进化特征。方法 2017年1-12月在昆明市连续收集新报告的HIV-1抗体阳性的MSM血浆样品228份,提取病毒核糖核酸(RNA),通过巢式聚合酶链反应(PCR)扩增gag、pol和env区基因片段,进行基因分型和基因耐药分析,通过MCMC方法分析MSM中主要HIV-1基因型的进化特征。结果 228份血浆样品中,180份获得基因分型结果,共检测到5种HIV-1基因型,包括77份(42.8%)CRF07BC,71份CRF01AE(39.4%)、5份CRF08BC(2.8%)、2份CRF5501B(1.1%)和25份URFs(13.9%)。基因型的分布在地区类别、年龄、民族、婚姻状况和文化程度方面无统计学意义。MSM中CRF01AE、CRF07BC和CRF08BC的进化速率的中位数分别为3.14×10-3、1.76×10-3和3.30×10-3 substitutions/site/year,其最近的共同祖先时间的中位数分别为1991.7、1999.1和2005.7。研究对象中携带监测相关的耐药突变(SDRMs)的比例为1.6%(3/182)。结论昆明市MSM中HIV-1的主要基因型发生了动态改变,CRF08BC进入该人群的时间晚于CRF01AE和CRF07BC,耐药株保持了低度流行水平。
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