为解决基础医学实验教学中综合类、设计类实验大规模开展困难,学生思维训练不足,多学科知识交叉融合及综合运用能力缺乏等问题,利用虚拟仿真技术优势,提出整合性思维培养为目标、以实验流程再造为主线、以学科间交叉融合为重心、以思维训练为核心的设计理念。自主研发了基于科学研究思维培养的基础医学虚拟仿真综合实验并应用于教学实践,成效显著,获批国家虚拟仿真实验教学一流课程。该文从研发背景、设计思路、建设内容、教学实践、建设成效等方面进行经验分享,为虚拟仿真实验教学研究提供经验参考。