基于TCGA数据库研究KCNT2在肺腺癌中的表达及与患者预后的相关性

作者：刘翼; 吴强; 杨龙海; 周孜孜; 张晓明; 曾薇

来源：实用癌症杂志, 2023, 38(02): 197-201.

DOI：10.3969/j.issn.1001-5930.2023.02.006

• 肺腺癌
• 癌症基因组图谱数据库
• 钠激活钾通道蛋白基因

目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库，观察钠激活钾通道蛋白基因KCNT(potassium sodium-activated channel subfamily T member 2,KCNT2)在肺腺癌癌组织中的表达及临床意义。方法 从TCGA数据库中下载肺腺癌组织的RNASeq数据以及临床数据，分析KCNT2 mRNA在肺腺癌组织和正常组织中的表达差异；以KCNT2表达水平的中位值(0.143)为界限将肺腺癌患者分为KCNT2高表达组和KCNT2低表达组，应用单因素及多因素COX回归分析癌组织中KCNT2表达与患者临床病理特征的关系及预后的相关性。应用基因集富集分析(GSEA)软件分析预测KCNT2在肺腺癌中可能的调控信号通路。结果 肺腺癌组KCNT2表达水平低于正常对照组(P<0.05);肺腺癌组织中KCNT2的表达水平与患者Stage分期相关(P<0.05);Stage分期(HR=1.947,95%CI:1.236～3.066,P=0.004)可以作为肺腺癌的独立预后因素；KCNT2低表达组生存率低于KCNT2高表达组(P=0.035);KCNT2主要参与氧化磷酸化信号通路、核糖体、嘧啶代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、谷胱甘肽代谢、RNA聚合酶等信号通路。结论 KCNT2在肺腺癌组织中呈低表达，与肺腺癌患者的预后相关，并通过参与多种信号通路促进肺腺癌的发生发展，可能是肺腺癌诊断和治疗的潜在生物标志物。

• 单位
  深圳大学总医院; 南方医科大学南方医院; 新疆医科大学附属肿瘤医院