染色体是由核苷酸序列排列而成,并通过折叠盘旋形成一定的空间结构。染色体在折叠盘旋时相互接触形成调控因子,调控生物体的各项生命活动。现阶段染色体空间结构的表示方法是将三维的空间结构表示成二维的接触矩阵,接触矩阵中的值使用Hi-C等高通量测序技术得到,这个值表示两个染色体片段的接触次数。而生物方法存在实验周期长、代价高等问题,本文针对生物实验中存在的问题,提出了一种基于卷积神经网络的染色体交互预测算法,并取得了较好的预测效果。