斑点叉尾鮰EGFL9基因变异位点与生长性状的关联分析

作者：张文平; 张世勇^*; 刘洪岩; 徐思琪; 王明华; 钟立强; 边文冀; 朱明; 陈校辉^*

来源：福建农业学报, 2023, 38(03): 253-261.

DOI：10.19303/j.issn.1008-0384.2023.03.001

• 斑点叉尾鮰
• EGFL9
• SNP
• 生长性状
• 关联分析

【目的】研究斑点叉尾鮰表皮生长因子样结构域蛋白EGFL9(Multiple epidermal growth factor-like domains protein 9)基因与其生长性状的相关性，为斑点叉尾鮰的分子标记辅助育种奠定基础。【方法】采用靶向基因测序技术对EGFL9基因进行测序，与参考基因组比对后筛选变异位点，并将获得的变异位点与生长性状进行关联分析。【结果】在EGFL9上共发现27个多态位点，经过滤，获得22个有效突变位点，其中4个变异位点（g.142、g.573、g.3079、g.7409）对斑点叉尾鮰的生长性状具有显著影响，位点g.142、g.3079、g.7409位于内含子中，位点g.573位于第2外显子上；g.142位点的A/A型个体的平均体长显著高于A/G型个体（P<0.05）;g.7409位点A/G型个体的平均体长显著高于G/G型、A/A型个体（P<0.05）;g.3079位点C/C型个体的平均体质量和体长均显著高于A/A型个体（P<0.05）；位于外显子上的InDel位点g.573使EGFL9基因编码蛋白减少了一个苏氨酸残基，对蛋白质三级结构产生较为明显的影响，该位点TACC/T型个体的平均体质量显著高于TACC/TACC型个体（P<0.05），平均体长显著高于TACC/TACC型与T/T型个体（P<0.05）。【结论】获得的4个斑点叉尾鮰生长相关标记（g.142、g.573、g.3079、g.7409）与其生长性状显著关联，可以应用于后续斑点叉尾鮰育种芯片开发和分子标记辅助育种。

• 单位
  江苏省淡水水产研究所