雪胆属转录组的EST-SSR分子标记开发

作者：陈薇薇; 幸宁

来源：安徽农业科学, 2023, 51(09): 160-163.

• 雪胆属
• 转录组
• EST-SSR分子标记
• 遗传多样性

[目的]开发雪胆属表达序列标签简单重复序列(SSR)分子标记。[方法]对雪胆属肉花雪胆和母猪雪胆2个种进行转录组测序，检测SSR位点并设计引物，通过PCR扩增和毛细管电泳检验引物的有效性和多态性，并分析种间和种内遗传多样性。[结果]从200对引物中筛选出6对具有高多态性的引物，每对引物检测到的等位基因数5～8个，平均值6.333 3个。有效等位基因(Ne)为2.480 7～4.982 8个，平均值3.760 8个。多态信息含量(PIC)为0.549 5～0.758 3,平均值0.672 9。遗传多样性分析显示，种间和种内居群均存在明显的遗传分化。[结论]该研究开发的EST-SSR引物具有丰富的多态性，为雪胆属植物的遗传多样性研究提供参考依据。

• 单位
  安顺学院