准噶尔双峰驼DGAT1基因外显子8序列生物信息学分析

作者：姚怀兵; 马强; 李玲; 闫慧; 郝泽林; 岳海涛; 王玉琢; 马英俊; 毋状元; 汪亮; 陈钢粮; 杨洁^*; 华实^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2022, (21): 122-142.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2022.01.0042

• 双峰驼
• DGAT1基因
• 外显子8
• 蛋白质
• 生物信息学分析

为了研究准噶尔双峰驼二酰基甘油酰基转移酶1(diacylgycerol acyltransferase 1, DGAT1)基因外显子8编码区的理化性质与结构，以及为寻找与双峰驼泌乳性状相关的分子遗传标记提供基础资料，试验对准噶尔双峰驼DGAT1基因外显子8进行PCR扩增，利用生物信息学方法对DGAT1蛋白结构、理化性质及信号肽、跨膜位置等进行分析，并比较了准噶尔双峰驼与其他物种DGAT1氨基酸序列的进化关系。结果表明：准噶尔双峰驼DGAT1基因外显子8扩增产物大小为421 bp,编码484个氨基酸，有1个保守域，位于62～468位氨基酸处。DGAT1蛋白属于亲水性蛋白，且为不稳定的非经典分泌蛋白。二级结构中，α-螺旋占48.35%,延伸链占14.46%,β-转角占4.13%,无规则卷曲占33.06%,存在9个蛋白跨膜结构区域。骆驼科的双峰驼、单峰驼和野骆驼的DGAT1蛋白独立成支，与牛DGAT1蛋白的分子进化距离相距较远。准噶尔双峰驼DGAT1基因外显子8序列及蛋白质结构与牛DGAT1蛋白卷曲方式、立体空间结构方面基本一致。说明DGAT1基因在物种间变异不大。

• 单位
  新疆畜牧科学院