基于HER-2相关基因构建风险模型用于膀胱癌生存预后评估

作者：刘欢锐; 彭祥; 李森林; 苟欣^*

来源：北京大学学报(医学版), 2023, 55(05): 793-801.

DOI：10.19723/j.issn.1671-167X.2023.05.004

• 膀胱癌
• HER-2相关基因
• 风险模型
• 预后
• 免疫细胞浸润

目的：探讨HER-2相关基因(the human epidermal growth factor receptor-2-related genes, HRGs)与膀胱癌生存预后的相关性，并基于HRGs构建一种膀胱癌患者生存预后的预测模型。方法：从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)中下载膀胱肿瘤组织mRNA测序数据和临床数据，通过与分子签名数据库(the molecular signatures database, MSigDB)中HER-2相关的基因联合分析鉴定膀胱癌中的HRGs。利用单因素和多因素Cox回归分析进一步明确与膀胱癌生存相关的HRGs(P<0.05),并构建HRGs风险模型(HRGs risk score model, HRSM),根据风险评分取中位数将膀胱癌患者分成高风险组和低风险组。利用R语言对高风险和低风险组的患者进行生存分析，并对HRGs与临床特征的相关性进行分析。利用多因素Cox回归分析，验证影响膀胱癌患者预后的独立因素。计算HRSM的受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve, ROC)下的面积(area under the curve, AUC),并构建诺模图(nomogram)对膀胱癌患者进行生存预测。利用TIMER数据库对HRSM和患者免疫细胞浸润相关性进行分析。结果：共鉴定到13个与患者生存相关的HRGs。通过多因素Cox回归分析，筛选出5个基因(BTC、CDC37、EGF、PTPRR和EREG)构建HRSM,高风险组的膀胱癌患者5年生存率明显低于低风险组患者。通过临床相关性分析发现，PTPRR的高表达与肿瘤分级、分期呈显著负相关，而EREG的高表达与肿瘤分级、分期呈正相关；EGF表达量的增加和患者的高级别有相关性，而CDC37的高表达却呈现出了相反的结果；BTC的表达与临床特征无显著相关性。通过对HRSM与免疫细胞的相关性分析发现，风险评分与树突状细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、中性粒细胞和巨噬细胞的浸润呈正相关。结论：HRGs对膀胱癌患者的预后有重要作用，可能作为新的预测性生物标志物和治疗的潜在靶点。

• 单位
  重庆医科大学附属第一医院