基于GEO数据库筛选卵巢癌细胞A2780的耐顺铂关键基因及其信号通路

作者：吴波; 吴媛媛

来源：重庆医学, 2020, 49(13): 2187-2192.

• 卵巢肿瘤
• 顺铂
• 抗药性,肿瘤
• 生物信息学
• GEO数据库

目的基于芯片数据采用生物信息学方法寻找卵巢癌耐化疗药物的关键分子及通路。方法在公共基因芯片数据库(GEO)中下载卵巢癌细胞经化疗药物处理的数据集GSE47856,挑选出顺铂处理卵巢癌细胞A2780的mRNA表达谱芯片数据,使用R语言进行生物信息学分析。结果获得27个与A2780顺铂耐药相关的差异基因,其中上调表达13个,下调表达14个,并且这些基因参与磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)、P53、转化生长因子β(TGF-β)等信号通路。相关分析显示,BTG2和INHBE、SULF2和INHBE、SULF2和WDR63之间具有明显相关性。结论卵巢癌顺铂耐药可能与BTG2、INHBE、SULF2和WDR63等基因表达相关。

• 单位
  宁夏医科大学总医院