植物转录因子MYC基因家族的生物信息学分析

作者:段龙飞; 李文燕; 黄文洁; 慕小倩; 蔡阳光; 覃剑锋; 陈中健; 郭邦利; 陈国爱
来源:分子植物育种, 2022, 1-14.

摘要

MYC家族是bHLH转录因子超家族的成员之一,是植物茉莉酸信号转导途径中的重要转录因子。为了揭示MYC基因家族在整个植物进化过程中的分子进化规律。本研究采用生物信息学分析方法,对15个代表性的植物MYC家族进行分子进化分析。结果显示:共鉴定出116个含有bHLH-MYC_N (PF14215)结构域的基因,562个含bHLH结构域(PF00010)的基因和61个MYC家族成员;植物基因组中的MYC家族可分为5个保守的亚家族,且亚家族之间发生功能分化现象。内含子的丢失导致MYC形成两种类型的基因结构,基因结构的改变可能是MYC家族基因进化的一种有效机制;基因表达分析表明,MYC家族基因在水稻和拟南芥不同组织器官及不同的胁迫应答反应中发挥重要作用。本研究结果将为MYC基因家族的深入研究提供参考依据。