高通量测序研究甲苯咪唑对黑猩猩肠道菌群的影响

作者:汪丽芬; 楼毅; 顾江萍; 曹新阳; 朱岩; 俞红燕*
来源:黑龙江畜牧兽医, 2020, (04): 129-154.
DOI:10.13881/j.cnki.hljxmsy.2019.04.0420

摘要

为了探讨甲苯咪唑对黑猩猩肠道菌群结构与多样性的影响,试验收集5只健康成年黑猩猩用药前及用药1 d、3 d、7 d 4组的新鲜粪样,采用高通量测序技术对用药前后肠道菌群结构组成和多样性进行生物信息学分析。结果表明:1)服用甲苯咪唑前后的4个时间点之间,肠道菌群Alpha多样性未发生显著差异(P>0.05)。2)在门水平,用药7 d组螺旋体门(Spirochaetes)显著低于用药前组(P<0.05),WPS-2门(Wittenberg polluted soil 2)显著低于用药1 d组(P<0.05),放线菌门(Actinobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia)显著低于用药3 d组(P<0.05)。3)在属水平,假单胞菌属(Pseudomonas)、RFN20属、YRC22属、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、罗斯氏菌属(Roseburia)、普式粪杆菌属(Faecalibacterium)、氨基酸杆菌属(Acidaminobacter)、密螺旋体属(Treponema)、考拉杆菌属(Phascolarctobacterium)之间差异显著(P<0.05)。说明甲苯咪唑驱虫用药不会引起黑猩猩肠道菌群多样性的改变,但对门和属水平上一些菌群的丰度均存在显著影响。