生物信息学方法研究高脂饮食诱导肥胖对雄性SD大鼠的影响

作者：贾艳飞; 郭颖; 张蔚; 张开舒; 傅龙龙; 安琪; 童越; 谷翊群

来源：生殖医学杂志, 2017, (08): 820-826.

• 生物信息学
• 肥胖
• 生殖
• 差异基因 Bioinformatics analysis
• Obesity
• Reproduction
• Differentially expressed gene

目的应用生物信息学方法探寻高脂饮食诱导性肥胖雄性SD大鼠生理代谢改变及对生育力的影响。方法利用NCBI中的GEO基因芯片公共数据库进行芯片数据搜索,最终选择芯片数据(GSE8700)作为分析对象,使用bioconductor包中R工具的函数及Limma程序包识别差异性表达基因,应用DAVID数据库对差异表达基因进行GO富集分析和KEGG通路分析,选用String在线数据库构建差异表达基因的PPI网络。结果通过对GSE8700进行分析,得到1 014个表达差异基因,其中上调基因544个,下调基因470个;上调差异基因GO条目全部富集于生物过程(BP),主要为氧化还原、轴突生成、对肽类激素反应、对...

• 单位
  中国医学科学院北京协和医院; 国家卫生计生委科学技术研究所