基于生物信息学途径研究CLDN4基因在卵巢癌中的作用及机制

作者：何竞宇; 王振怡; 杨林; 刘博成; 尹智慧; 白云^*

来源：中国妇幼保健, 2023, 38(06): 983-988.

DOI：10.19829/j.zgfybj.issn.1001-4411.2023.06.004

• 卵巢肿瘤
• 紧密连接蛋白
• Oncomine数据库
• TCGA数据库
• GEO数据库

目的 基于生物信息学途径，研究紧密连接蛋白4(CLDN4)在卵巢癌中的作用机制。方法 从GEO数据库获取含有12个卵巢癌组织和正常组织的基因芯片，结合Oncomine数据库进行CLDN4 mRNA表达差异分析，筛选出差异基因109个，利用Cytoscape 3.8.2软件进行GO富集和KEGG富集分析，String数据库进行蛋白相互作用网络分析，找到关键节点蛋白16个，选取差异最大的CLDN4基因进行深入探讨，进行表达分析和GeneMANIA功能预测。结果 筛选109个差异基因进行GO富集和KEGG信号通路分析，发现参与Wnt/β-catenin、MAPK、MEK-ERK等信号通路；构建功能模块，找到关键蛋白16个，其中CLDN4 mRNA在卵巢癌中高表达，CLDN4表达与临床分期和生存状态有相关性；预测CLDN4基因在功能上与顶端连接复合体、细胞-细胞连接、内皮屏障的建立、内皮细胞发育与分化等有关。结论 CLDN4在卵巢癌中高表达，在癌细胞的增殖、转移中有一定作用，有望成为诊断和治疗卵巢癌的新生物标记物。

• 单位
  华北理工大学; 生命科学学院