目的分析应用经颅磁刺激治疗癫痫的临床疗效及安全性。方法选取2015-01—12我院治疗的60例癫痫患者为研究对象,采用随机分组的方式分为观察组与对照组各30例。观察组在药物治疗基础上加用经颅磁刺激治疗,对照组仅用药物治疗。对比2组有效率及不良反应发生率。结果观察组有效率明显高于对照组,不良反应发生率明显低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论应用经颅磁刺激治疗癫痫的疗效更显著,且可有效降低不良反应发生率,值得临床应用与推广。