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摘要
【目的】建立基于16S rRNA序列和gyrB基因串联DNA特征序列的属内菌种鉴定方法，为气单胞菌的种间区分提供技术支持。【方法】以2020—2021年在我国福建、江苏等地分离获得的水产源气单胞菌和NCBI已公布且完成全基因组测序的10种气单胞菌为研究对象，分别以16S rRNA序列、gyrB基因及2个基因序列串联后得到的新DNA特征序列作为构建系统发育进化树的依据，比较不同系统发育进化树的鉴定结果，并以运动性试验、溶血性试验、糖发酵试验进行辅助鉴定。【结果】在基于16S rRNA序列构建的系统发育进化树中，中间气单胞菌、嗜水气单胞菌、达卡气单胞菌、肠源气单胞菌等聚类在不同分支上，未能形成独立的种属进化分支；在基于gyrB基因构建的系统发育进化树中，达卡气单胞菌、豚鼠气单胞菌和嗜水气单胞菌聚类在同一分支上，而异嗜糖气单胞菌和维氏气单胞菌聚类在另一分支上。将16S rRNA序列和gyrB基因串联组成新DNA特征序列再构建系统发育进化树建树，能完全有效分离气单胞菌属的不同菌株，将不同种的气单胞菌独立聚为一支，较好地实现种间区分。【结论】将16S rRNA序列和gyrB基因串联组成新DNA特征序列再构建系统发育进化树，较基于16S r RNA序列或gyrB基因单独构建系统发育进化树具有更高的分辨力，是一种理想的保守序列相似性高的属内菌种鉴定方法。因此，在16S rRNA测序鉴定为气单胞菌的情况下可再次以gyrB基因为测序对象，获得序列信息后与16S r RNA序列串联构建系统发育进化树，能更加精确地将气单胞菌鉴定到种水平。
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单位国家水生动物病原库; 上海海洋大学
