利用转录组测序鉴定玉米白色籽粒突变基因PDS

作者：付修义; 殷鹏飞; 季生辉; 贾博森; 许静; 杨小红

来源：中国农业大学学报, 2019, (07): 1-9.

• 玉米
• 转录组测序
• EMS突变体
• 类胡萝卜素
• 八氢番茄红素去饱和酶 maize
• transcriptome sequencing
• EMS mutant
• carotenoids
• phytoene desaturase

为探讨转录组测序在玉米质量性状基因克隆上的应用,以玉米自交系B73籽粒表现为白色的EMS突变体为材料,对该突变体授粉后15 d的籽粒进行转录组分析。通过与玉米B73参考基因组序列的比对分析,共鉴定到138个突变位点,其中51个突变位点对基因的功能有显著影响。通过基因功能注释与分类,发现该突变体在类胡萝卜素合成途径中的八氢番茄红素去饱和酶基因(PDS)发生无义突变,导致PDS蛋白翻译提前终止,阻断类胡萝卜素代谢途径中有色体番茄红素的生物合成,造成玉米籽粒白化。这些结果表明利用转录组测序技术能够快速准确地鉴定玉米EMS突变体的突变基因。

• 单位
  中国农业大学