广西华珊瑚蛇线粒体基因组全序列测定与分析

作者：周圣博; 孟佳瑶; 智歆然; 周滋航; 彭杰; 覃再林; 关萍^*

来源：动物学杂志, 2022, 57(04): 481-492.

DOI：10.13859/j.cjz.202204001

• 广西华珊瑚蛇
• 线粒体基因组
• 序列分析
• 系统进化

本研究对眼镜蛇科广西华珊瑚蛇（Sinomicrurus peinani）线粒体基因组序列进行测定与分析，并探究其与近缘种的系统发育关系。结果表明，广西华珊瑚蛇线粒体基因组是一条全长19 477 bp的环状DNA，基因组碱基构成为A(33.4%）、T(28.1%）、C(26.6%）和G(11.9%）。共编码38个基因，包含2个核糖体RNA(r RNA）基因、22个转移RNA(t RNA）基因、13个蛋白质编码基因及1个线粒体基因控制区（D-loop）。13个蛋白质编码基因均采用AUG作为起始密码子，UAA和UGA作为终止密码子；蛋白质编码基因编码频率较高的氨基酸分别为亮氨酸（Leu）、异亮氨酸（Ile）、苏氨酸（Thr）和丝氨酸（Ser）；相对密码子使用度（RSCU）频率最高的4个密码子依次是CGA、UGA、CUA和CCA。22个t RNA，除t RNASer（一臂两环）外其他均可形成典型三叶草结构。基于眼镜蛇科线粒体基因组系统发育分析结果表明，与广西华珊瑚蛇关系最密切的是中华珊瑚蛇（Sinomicrurus macclellandi），其次是孟加拉眼镜蛇（Naja kaouthia）与眼镜王蛇（Ophiophagus hannah）。

• 单位
  沈阳农业大学