胡桃楸成花相关LFY同源基因的克隆和序列分析

作者：张丽杰; 宋佳兴; 王斯彤; 陆秀君; 沈海龙

来源：分子植物育种, 2017, 15(07): 2550-2555.

DOI：10.13271/j.mpb.015.002550

• 胡桃楸
• cDNA全长
• 序列分析

通过对胡桃楸成花相关LFY基因进行研究,对缩短胡桃楸童期,促进其提早开花结实有着极为重要的意义。采取PCR扩增技术,在NCBI数据库中进行搜索,查找到与目的基因有关联的同源序列;并根据这些有关联的序列来进行引物设计,扩增目的基因全长。克隆LFY基因cDNA序列全长为1 297 bp,其中CDS序列长1 158 bp,编码385个氨基酸。NCBI数据库Blast比对表明胡桃楸LFY同源基因与其他物种的LFY同源基因同源性均在80%以上。将胡桃楸LFY同源基因命名为JmLFY(GenBank登录号:KX364241)。通过BioEdit软件和ProtParam ExPASy在线软件分析胡桃楸JmLFY蛋白质分子式为C1878H2962N566O578S13,分子量为43 134.4 Da;理论等电点pI值为6.78;不稳定指数为39.92,属于不稳定蛋白质。该研究为进一步探索LFY基因对胡桃楸成花的影响提供依据。

• 单位
  林木遗传育种国家重点实验室; 东北林业大学; 沈阳农业大学; 辽宁省固沙造林研究所