高粱AAP蛋白家族基因鉴定及表达分析

作者：孙丽莎; 宋巨奇; 彭晶晶; 阮美丽; 魏金鹏; 徐晶宇; 李佐同; 赵长江

来源：分子植物育种, 2022, 1-12.

• 高粱
• AAP
• 基因家族
• 生物信息学

氨基酸通透酶(amino acid permease， AAP)是一种跨膜转运蛋白，广泛参与植物氨基酸的吸收和转运。本研究采用生物信息学方法解析高粱AAP家族基因的特征，并通过盐和低温处理高粱转录组数据， 分析SbAAPs基因表达谱。研究发现，在高粱全基因组水平上共鉴定出21个高粱AAPs基因，根据进化关系将其划分为7个亚族，分布在9条染色体上。其中SbAAP3、SbAAP5和SbAAP21预测定位在细胞质中，其余均定位在细胞质膜上。高粱生育期组织数据库分析发现，SbAAP13、SbAAP1、SbAAP2、SbAAP15、SbAAP18、SbAAP14和SbAAP19在高粱的叶片、茎和根部表达量较高。在低温胁迫下，SbAAP13、SbAAP19、SbAAP2、SbAAP18、SbAAP7、SbAAP15、SbAAP1、SbAAP9和SbAAP17与对照相比呈现下调表达的趋势，SbAAP8和SbAAP14与对照相比呈现上调表达的趋势；在盐胁迫处理下，SbAAP2、SbAAP7、SbAAP17、SbAAP6、SbAAP19和SbAAP13与对照相比呈现下调表达的趋势，SbAAP18、SbAAP16和SbAAP9则呈现上调表达的趋势。表达数据与基因启动子区存在大量激素和非生物胁迫相关顺式作用元件有一定的关联。本文研究可为高粱AAP家族基因功能解析提供理论基础。

• 单位
  黑龙江八一农垦大学