50份黄瓜核心种质的SSR标记筛选和聚类分析

作者：金庆敏; 林毓娥; 吴廷全; 钟玉娟; 王瑞

来源：广东农业科学, 2023, 1-13.

• 黄瓜
• 核心种质
• SSR标记
• 多态性分析
• 聚类分析
• 遗传多样性

【目的】分析50份来自全国各地的黄瓜核心种质资源的遗传多样性，为黄瓜育种提供依据和参考。【方法】本研究对50份黄瓜核心种质资源的重要外观农艺性状进行了统计，并利用全基因组设计了66对SSR引物对其进行分子标记筛选及遗传多样性聚类分析。【结果】供试50份黄瓜核心种质材料的瓜皮颜色、刺瘤、瓜皮斑纹具有多样性。66对引物中有32对引物能够在不同黄瓜种质间扩增出清晰而稳定的多态性标记，该32对SSR引物共扩增出280个等位基因片段，其中多态性片段216个，占片段总数的77.1%。表明本研究筛选出的32对SSR引物遗传多态性较高，适用于黄瓜种质材料的遗传多样性分析。聚类结果与所调查的种质资源性状表现结果较为一致。50份黄瓜核心种质遗传相似系数最低为0.62，最高达1.00。在遗传相似系数为0.745处，50份黄瓜种质材料聚为7类，即9份华南型材料聚为6类：I类、III类、IV类、V类、VI类、VII类，其中IV类包含1份中间材料与9号华南型材料；40份华北型黄瓜材料聚为1类：II类。表明华北型黄瓜材料和华南型黄瓜材料间相似系数低、亲缘关系远；华北型黄瓜材料间相似系数高、亲缘关系近、遗传背景窄、遗传多样性差；而华南型黄瓜材料间相似系数较低、亲缘关系较远、遗传背景宽、遗传多样性丰富。【结论】本研究筛选出32对SSR引物，可有效对50份黄瓜核心种质材料进行聚类分析，遗传相似系数为0.745处50份黄瓜材料聚为7类，其结果与性状调查结果相吻合。此外，华北型黄瓜遗传背景窄，遗传多样性差；华南型黄瓜遗传背景相对较宽，遗传多样性丰富。

• 单位
  广东省蔬菜新技术研究重点实验室; 广东省农业科学院蔬菜研究所; 广东省农业科学院