大白菜BrSPS1Fb基因剪接受体位点变异及其对剪接的影响

作者：陶鹏; 岳智臣; 赵彦婷; 雷娟利; 李必元^*

来源：浙江农业学报, 2021, 33(11): 2068-2074.

• 大白菜
• 单核苷酸多态性(SNP)
• 剪接受体位点
• SPS1F
• 选择性剪接

为研究剪接受体位点变异对剪接方式与效率的影响,对大白菜材料He2进行重测序,发现BrSPS1Fb-He2第6个内含子(I6)的剪接受体位点由AG突变为AC。对大白菜材料He2花瓣进行转录组测序并分析BrSPS1Fb-He2 read数据,结果显示,BrSPS1Fb-He2在pre-mRNA加工过程中发生了选择性剪接。BrSPS1Fb-He2可选择3个位置(A1、A2和A3)作为受体进行剪接,产生3种剪接异构体(S1、S2和S3),或者保留I6整个内含子,形成S4剪接异构体。大白菜BrSPS1Fb-He2的成熟mRNA中保留部分I6(S1和S2)或全部I6(S4),或者缺失部分E7外显子序列(S3)。综上,BrSPS1Fb剪接受体位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)变异对其转录后剪接产生了显著影响。

• 单位
  浙江省农业科学院