基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术对非结核分枝杆菌的鉴定与分型

作者：李松; 姚妍娇; 屈平华; 陈茶; 张伟铮; 李启伟; 许振杰; 陈富

来源：中华检验医学杂志, 2018, 41(02): 109-115.

• 非结核分枝杆菌
• 光谱法,质量,基质辅助激光解吸电离
• 利福平
• 抗药性,细菌
• 聚类分析

目的以CLSI-MM18A(病原菌DNA测序鉴定的解释指南)推荐的RPOB(利福平耐药)基因为参考标准,评价基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对非结核分枝杆菌的鉴定和分型的水平的能力。方法收集2012年至2016年从临床分离的不同感染部位的55株NTM菌株,利用RPOB进行管家基因测序,并对测序结果进行系统发育进化分析;同时利用MALDI-TOF MS技术对菌株进行鉴定,并对蛋白指纹图谱进行聚类分析;评价两种方法对NTM鉴定和分型的一致性。结果 RPOB基因对55株NTM显示了很好的鉴定(测序结果TM值均大于99%)和分型(可区分到复合群内的种或亚种)能力;法国BioMerieux MALDI-TOF MS技术对55株NTM的鉴定到属的水平为89.1%,鉴定到种的水平为78.2%,鉴定水平良好;利用SARAMS Premium软件对蛋白指纹图谱的聚类分析也显示出了良好的分型能力。结论 MALDI-TOF MS技术可以有效的对非结核分枝杆菌进行鉴定和分型,其检测周期短,操作简便,在实验室中与RPOB基因联合应用有着很好的互补性。

• 单位
  广州中医药大学第二附属医院; 广东省中医院; 广州市天河区冼村街社区卫生服务中心