24位点可变串联重复序列和间隔区寡核苷酸分型对河南省结核分枝杆菌基因型的鉴定

作者：石洁; 郑丹薇; 朱岩昆; 赵俊伟; 马晓光; 王少华; 李辉^*; 邢进

来源：中华传染病杂志, 2018, 36(12): 741-746.

• 分枝杆菌,结核
• 24位点分枝杆菌散在重复单元-可变串联重复序列
• 间隔区寡核苷酸分型

目的了解河南省结核分枝杆菌的基因型别。方法采用经典24位点分枝杆菌散在重复单元-可变串联重复序列(mycobacterium interspersed repetitive unit-variable number of tandem repeat,MIRU-VNTR)和间隔区寡核昔酸分型(spoligotyping)对2015年间河南省不同地区的668株结核分枝杆菌进行基因分型。结果间隔区寡核苷酸分型将668株菌分为11个家族,35个基因型。在558株北京家族基因型中,典型北京家族菌株546株,非典型北京家族菌株12株。在110株非北京家族菌株中,8株为新发现菌株;另102株非北京家族菌株被分为10个家族,其中T家族有76株,包括T1家族59株,T2家族7株,T3家族10株。标准24位点VNTR将668株菌分为550个基因型,有508株菌显示出单一的基因型,另160株菌被分到42个不同的基因簇中。最大簇含有21株菌,其余簇包含2～20株菌。结论河南省结核分枝杆菌主要为北京家族基因型。

• 单位
  郑州大学第一附属医院; 河南省疾病预防控制中心