AML铜死亡相关lncRNA预后风险模型的构建

作者:谢文杰; 王智超; 郭小芳; 管洪在*
来源:青岛大学学报(医学版), 2023, 59(06): 826-831.
DOI:10.11712/jms.2096-5532.2023.59.190

摘要

目的 采用生物信息学分析方法对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中急性髓细胞白血病(AML)数据进行分析,建立铜死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)预后风险模型,并进行效能验证。方法 通过共表达和单因素Cox回归分析鉴定与预后相关的铜死亡相关lncRNA。采用lasso回归和多因素Cox回归分析选出最优的铜死亡相关lncRNA构建预后风险模型,根据风险模型评分将AML病人分为高、低风险组。采用校准曲线、C指数、受试者工作特征(ROC)曲线以及临床决策曲线评价预测模型。结果 共获得4个与AML病人预后相关性最佳的铜死亡相关lncRNA(LINC01547、LINC02356、NORAD和AC000120.1),基于此4个lncRNA构建列线图模型来预测AML病人1、3、5年预后,预测的准确性较高,C指数为0.686,在训练集中1、3、5年预后预测的ROC曲线下面积分别为0.758、0.717和0.804,在测试集中则分别为0.704、0.682和0.927。在训练集和测试集中,高风险组病人的生存率均明显低于低风险组。结论 基于铜死亡相关lncRNA构建的预后风险模型评分是一个独立的预后因素,可有效预测AML病人的预后。

  • 单位
    青岛大学附属医院

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