结合RNA的蛋白质位点预测研究

作者：查磊; 应晓敏; 李伍举

来源：军事医学, 2012, (11): 830-834.

• 蛋白质-RNA复合物
• 结合位点
• 预测模型 protein-RNA complex
• binding sites
• prediction model

目的尝试通过构建数学模型来确定蛋白质中与RNA相互作用的氨基酸位点。方法从蛋白质结构数据库(protein data bank,PDB)中收集532例蛋白质与RNA相互作用的数据,对每个氨基酸提取150个特征,并利用机器学习方法构建2个与RNA结合的蛋白质位点预测模型。结果经过在同一数据集上与其他模型比较,所构建的模型具有更好的性能。结论该预测模型的建立,为研究人员获得与RNA结合的蛋白质位点提供了较好的生物信息学支持。

• 单位
  军事医学科学院基础医学研究所