高分辨熔解技术常用荧光染料的SNP基因分型能力比较

作者：尤崇革; 李晓军; 郜莉娜; 李菲菲

来源：临床检验杂志, 2011, (08): 575-577.

DOI：10.13602/j.cnki.jcls.2011.08.008

• LC Green
• Syto 9
• Eva Green
• 高分辨熔解技术
• 单核苷酸多态性 LC Green
• Syto 9
• Eva Green
• high resolution melting
• single nucleotide polymorphism

目的评价LC Green、Syto 9和Eva Green 3种高分辨熔解(HRM)染料对单核苷酸多态性(SNP)基因分型的能力。方法以肿瘤坏死因子(TNF)基因启动子-857 C>T(rs1799724)位点为例,分别用上述3种荧光染料进行PCR-HRM检测,依据特征熔解曲线进行基因分型并测序验证。基因分型能力评价以野生型与纯合突变型PCR产物Tm值之差(△Tm)来表示。结果 PCR-HRM检测到4种特征熔解曲线,经测序后发现第4条为双突变杂合,包含-863C>A(rs1800630)位点。HRM染料LC Green,Syto 9,EVa Green的基因分型能力分别为(0.52±0.030...

• 单位
  兰州大学第二医院; 中国人民解放军东部战区总医院