PDE4D在哮喘患儿和哮喘模型的表达差异

作者：张秀青; 于春琳; 刘峰; 赵德育^*

来源：南京医科大学学报(自然科学版), 2019, 39(11): 1561-1566.

• PDE4D
• 哮喘
• GEO
• GWAS
• 肥大细胞

目的:筛选哮喘相关候选基因,并在人群和动物水平验证。方法:从高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)搜索哮喘痰相关基因芯片数据,利用GEO 2R筛选表达差异基因,并参考全基因关联分析(genome-wide association study,GWAS)筛选哮喘相关基因,收集哮喘患儿及同期健康儿童痰标本,构建小鼠哮喘模型、大鼠肥大细胞株(RBL-2H3)哮喘模型,应用RT-PCR进行验证。结果:共纳入2套哮喘痰基因芯片数据,选出有交集的差异表达基因190个,结合GWAS最终筛选出哮喘相关基因磷酸二酯酶4D(PDE4D)。进一步验证PDE4D在哮喘患儿痰样本中表达上调(P <0.05),但在哮喘小鼠模型整个肺组织中表达下调(P <0.05),而在致敏的RBL-2H3细胞中表达上调(P <0.05)。结论:PDE4D在人群、哮喘小鼠及肥大细胞中存在差异表达,可能作为肥大细胞参与哮喘发展的研究靶点。

• 单位
  南京医科大学