一株类禽型H1N1猪流感病毒的进化分析与分子特征

作者：李鑫; 葛菲菲; 刘健; 李壮壮; 吴杰; 杨德全; 鞠厚斌; 周锦萍^*

来源：中国动物检疫, 2019, 36(06): 80-87.

• 猪流感病毒
• H1N1
• 类禽型
• 遗传进化树
• 分子特征

2017年12月,上海市一养殖场饲养的猪出现咳嗽、呼吸困难、发热及迅速转归等病症。将猪鼻拭子接种鸡胚进行病毒分离,对血凝试验阳性样品在SPF鸡胚上进一步纯化、增殖,分离到1株猪流感病毒(A/swine/Shanghai/1205/2017)。采用RT-PCR对分离毒株进行全基因组扩增测序,利用DNAstar软件,对测序基因片段进行整个阅读框的核苷酸序列同源性比对分析,并用MEGA 6绘制遗传进化树并分析氨基酸位点。结果显示:分离毒株为H1N1亚型,其8个基因片段均属于类禽型H1N1进化分支,没有出现不同基因型流感病毒片段之间的重组;分离株HA蛋白的裂解位点序列为PSIQSR↓G,具有典型低致病性流感病毒的分子特征。本毒株的分离鉴定为分析我国大陆地区的猪流感流行状况和分子特征提供了参考。

• 单位
  上海市动物疫病预防控制中心; 扬州大学