基于RNASeq技术分析对乙酰氨基酚对斑马鱼转录组的影响

作者：康桂英; 董武; 杨景峰; 杨晓野^*

来源：中国兽医学报, 2019, 39(10): 2033-2039.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2019.10.24

• 对乙酰氨基酚
• 斑马鱼
• 荧光定量PCR
• 转录组

为了研究对乙酰氨基酚对斑马鱼发育影响,采用高通量转录组测序RNA-seq技术对对乙酰氨基酚处理组(CAPAP组)与对照组(CO组)斑马鱼进行检测,以斑马鱼基因(danio rerio assembly version GRCz10)作为参考基因组,对检测结果进行拼接与质量评估,筛选出差异表达基因,并进行GO和Pathway功能分析。荧光定量PCR对部分与肝脏有关的差异表达基因进行验证。结果表明,CO与CAPAP组的差异表达基因数量为72个,其中上调差异表达基因40个,下调差异表达基因32个。对CO与CAPAP组差异表达基因进行GO富集分析,上调基因主要富集于47个条目中,下调基因主要富集于16个条目中,这些基因涉及生物进程和分子功能等多种生物活性方面,说明对乙酰氨基酚对斑马鱼的发育有一定的影响。

• 单位
  内蒙古农业大学; 内蒙古民族大学