基于DGGE和Illumina MiSeq技术解析恩施地区米酒细菌多样性

作者：向凡舒; 折米娜; 何萌; 廖华; 赵慧君; 郭壮^*

来源：食品与发酵工业, 2019, 45(14): 41-62.

DOI：10.13995/j.cnki.11-1802/ts.018528

• 米酒
• 细菌多样性
• 变性梯度凝胶电泳
• MiSeq高通量测序

以10个恩施地区米酒为研究对象,采用变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)与MiSeq高通量技术对其细菌多样性进行了评价。DGGE结果表明,恩施地区米酒中的细菌主要为Weissella、Enterococcus、Pediococcus、Kosakonia和Lactobacillus。MiSeq高通量测序结果表明,米酒中的细菌属主要为隶属于Firmicutes的Pediococcus、Enterococcus、Weissella,以及隶属于Proteobacteria的Kosakonia和隶属于Bacteroidetes的Prevotella,其平均相对含量分别为58. 03%、10. 72%、8. 24%、3. 34%和2. 01%。在分类操作单元(operational taxonomic units,OTU)水平上,发现了6个核心OTU,其中OTU5646 (隶属于Pediococcus)的平均含量为54. 74%。采用传统纯培养技术共分离出17株乳酸菌,其中11株鉴定为Pediococcus pentosaceus。由此可见,Pediococcus为恩施地区米酒样品中的优势细菌。

• 单位
  湖北文理学院