血清外泌体中环状RNA通过竞争内源性RNA调控胰腺癌中外周血单个核细胞功能的研究

作者：井庆旭; 薛东波^*

来源：哈尔滨医科大学学报, 2021, 55(06): 561-592.

• 环状RNA
• 胰腺癌
• 竞争内源性RNA
• 外周血单个核细胞
• 外泌体

目的 探究胰腺癌血清外泌体中环状RNA对于外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMC)的调节机制及应用价值。方法 对基因芯片数据进行生物信息学分析，建立了在胰腺癌中的ceRNA网络，通过R语言、TargetScan以及Cytoscape等分析预测软件对GEO数据库中GSE100206、GSE100232、GSE37710、GSE49641的数据进行了分析和整合。利用GO功能分析以及Reactome pathway分析寻找相关基因的功能以及通路。利用cMap数据库，查找同时影响差异表达circRNA和差异表达mRNA的相关药物。结果 通过分析GSE100232以及GSE100206数据集，得到了559个在胰腺癌血清外泌体中具有差异表达的circRNA。通过分子海绵吸附原则预测了circRNA所对应的miRNA,其结果与GSE37710数据集中差异表达的miRNA进行比对，选取二者交集得到76个miRNA。通过生物信息学分析预测与miRNA所对应的mRNA,其结果与GSE49641数据集中差异表达的mRNA交集得到4个mRNA,对其进行整合得到ceRNA网络。分析得到PBMC相关调控通路，以及可以作为药物靶点的差异基因。结论 本研究在胰腺癌患者的血液中发现了显著改变的circRNA、miRNA和mRNA,可作为治疗胰腺癌诊断及治疗的潜在靶点。阐明了胰腺癌ceRNA互作网络在PBMC中的可行性。PBMC中的宿主基因可作为药物调控的靶点，进行深入研究。

• 单位
  哈尔滨医科大学附属第一医院