苦荞FtERF基因克隆、生物信息学及其表达分析

作者：张俊; 蔡苏云; 徐子豪; 侯蕾; 贺润丽^*; 尹桂芳; 王莉花^*; 王艳青; 卢文洁; 孙道旺

来源：作物杂志, 2023, 1-9.

• 苦荞
• 乙烯响应因子
• 生物信息学
• 表达分析

乙烯响应因子对植物发育和细胞代谢具有重要作用。本研究通过RT-PCR从苦荞中克隆出ERF基因，对其进行生物信息学分析和差异表达分析。结果表明，FtERF基因开放阅读框长度为729bp，编码了243个氨基酸，编码的蛋白分子量为26.08kD，等电点为9.22，属于亲水性蛋白。FtERF不含有信号肽和跨膜螺旋结构，亚细胞定位在细胞核内，蛋白质二级结构、三级结构高度相似。FtERF含有抑制基序DLNxxP，系统进化表明FtERF和ERF4关系较近。荧光定量表达发现，厚壳苦荞不同部位表达均高于薄壳苦荞，苦荞发育成熟期表达高于非成熟期。

• 单位
  山西中医药大学; 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所; 云南省农业生物技术重点实验室