狗枣猕猴桃锌指蛋白的生物信息学分析

作者：陈鑫; 李然红; 刘丹; 王立凤

来源：贵州农业科学, 2019, 47(07): 96-99.

• 狗枣猕猴桃
• 锌指蛋白
• 生物信息学

为狗枣猕猴桃锌指蛋白(AkZFP)功能的生产应用提供参考,利用生物信息学工具和方法,对锌指蛋白的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测。结果表明:AkZFP的cDNA全长为788bp,编码区(CDS)为678bp,由226个氨基酸构成的亲水性非稳定蛋白,属于ZF-C2H2-6蛋白家族(PFAM 13912),主要构件为α-螺旋和不规则卷曲,包含1个植物特有的QALGGH序列锌指C2H2型结构域,与其他20种植物的ZFP氨基酸序列进行对比,狗枣猕猴桃与中华猕猴桃变种亲缘关系较近。

• 单位
  牡丹江师范学院