热带无爪螨第1组分变应原的同源建模及表位分析

作者：王楠; 陈文艳; 周颖婷; 孙炜

来源：江苏科技信息, 2021, 38(36): 36-51.

• 热带无爪螨
• 第1组分变应原
• B细胞表位
• T细胞表位

目的:利用生物信息学方法对热带无爪螨第1组分变应原(Blo t 1)特征进行分析。方法:采用SignalP 4.1服务器用于分析Blo t 1的信号肽序列,ProtScale tools对Blo t 1的理化性质进行分析,NetPhos3.1服务器预测分析Blo t 1的磷酸化位点。采用SOPMA服务器预测其二级结构。结果:Blo t 1是一种亲水蛋白,其第1-18位氨基酸为Blo t 1的信号肽序列,磷酸化位点预测显示:Blo t 1含有16个丝氨酸激酶、12个苏氨酸激酶及16个酪氨酸激酶,没有跨膜结构域;Blo t 1的二级结构中包含α螺旋(氨基酸占比28.56%),β转角(氨基酸占比7.95%),延伸链(氨基酸占比19.05%)和无规则卷曲(氨基酸占比44.44%)。Blo t 1的B细胞表位有5个肽序列(38-43,115-118,125-130,156-159,204-212),T细胞表位预测得到3个肽序列(89-109,134-154,247-267)。结论:对Blo t 1的表位分析,为Blo t 1基于表位的疫苗和肽-ELISA的研发奠定理论基础。

• 单位
  江苏医药职业学院